В ходе проведения исследования были разработаны алгоритмы определения GC состава геномов и вычисления частоты встречаемости нуклеотидных последовательностей длины k; написаны программы на языке Python, реализующие данные алгоритмы. Проанализированы геномы вирусов SARS-CoV-2, выявленных в клетке человека, бактерий: Escherichia coli и Rhodoplanes. Было установлено, что разница между GC составом представителей одного вида - менее 0,5%; между составом оргазмов разных царств - более 40%. Различие GC составов бактерий разных классов составляет порядка 20%. В ходе анализа распределения частот встречаемости ди-, три- и тетрануклеотидных последовательностей было установлено, что данные метрики являются характерными для особей одного вида и различается у организмов разных таксономических единиц.
Подвиг М.В. (науч. рук. Логинов К.В.) Определение метрик нуклеотидных последовательностей геномов, полученных в процессе секвенирования // Сборник тезисов докладов конгресса молодых ученых. Электронное издание. – СПб: Университет ИТМО, [2020]. URL: https://kmu.itmo.ru/digests/article/5140