В данной работе разработан метод TCREmPNet для поиска фенотипически обогащённых клонотипов T-клеточных рецепторов в данных Rep-seq без априорного знания эпитопов. Подход основан на представлении TCR в виде эмбеддингов (TCREmP), совместной кластеризации исследуемого образца и контрольного фона (реальные или синтетические репертуары) и статистической оценке обогащения кластеров. Метод позволяет выявлять ассоциированные с состоянием иммунные сигналы в условиях высокой вариабельности репертуаров и неполноты аннотаций. TCREmPNet ориентирован на анализ крупных когорт и может применяться для поиска иммунных биомаркеров и повышения качества аннотаций TCR-баз данных.

Власова Е.К. (науч. рук. Шугай М.А.) Метод для поиска фенотипически обогащенных кластеров т-клеточных рецепторов // Сборник тезисов докладов конгресса молодых ученых. Электронное издание. – СПб: Университет ИТМО, [2026]. URL: https://kmu.itmo.ru/digests/article/18125