В работе разработаны предсказательные ML-модели риска пародонтита на основе WGS-метагеномных данных микробиома слюны. Сформирован объединённый датасет из 9 публичных репозиториев (367 образцов), обработанных единым пайплайном таксономической и функциональной аннотации. Для устранения батч-эффекта, обусловленного гетерогенностью исходных исследований, систематически сопоставлены три стратегии коррекции. Обученные модели предназначены для переноса на массив метагеномных профилей слюны компании Генотек с целью создания диагностического инструмента, выявляющего риск пародонтита непосредственно из данных полногеномного секвенирования.

Добровольский С.К. (науч. рук. Ракитько А.С., Денисова А.А.) Предсказание пародонтита на основе агрегированной выборки wgs-метагеномных данных микробиома слюны человека // Сборник тезисов докладов конгресса молодых ученых. Электронное издание. – СПб: Университет ИТМО, [2026]. URL: https://kmu.itmo.ru/digests/article/17339