Личный кабинет

Статья

Сердюков А.Н. (науч. рук. Муравьёв С.Б.) Разработка инструмента hict: переход от интерактивного прототипа к эксплуатационно‑устойчивой реализации
УДК тезиса: 575-112

Доклад посвящён разработке инструмента HiCT для интерактивного ручного скаффолдинга и валидации геномных сборок с использованием данных Hi‑C, а также визуализации карт Hi-C. Рассматриваются этапы перевода инструмента с экосистемы Python на Java и улучшения производительности через оптимизацию модели данных, что включает в себя разработку системы кэширования и параллельных запросов, а также улучшение интеграции с веб‑интерфейсом. В результате работы был достигнут качественный переход HiCT к более зрелому состоянию, улучшен пользовательский интерфейс, реализована возможность отслеживания прогресса длительных операций и повысились удобство и устойчивость сессий. Планируется дальнейшая реализация загрузчиков данных и стабилизация API серверной части для интеграции с инструментами машинного обу

Авторы:

Сердюков Александр Николаевич

Руководитель:

Муравьёв Сергей Борисович

Сердюков А.Н. (науч. рук. Муравьёв С.Б.) Разработка инструмента hict: переход от интерактивного прототипа к эксплуатационно‑устойчивой реализации // Сборник тезисов докладов конгресса молодых ученых. Электронное издание. – СПб: Университет ИТМО, [2026]. URL: https://kmu.itmo.ru/digests/article/17328