Представлен первый унифицированный бенчмарк взаимодействий «аптамер – малая молекула», объединяющий 6 413 аннотированных пар, 1 686 аптамеров и 1 041 лиганд, более 30 % записей содержат количественные аффинности. Проведено сравнительное тестирование моделей классификации и регрессии при различных схемах разбиения. Показано, что ограничение переносимости связано преимущественно с гетерогенностью химического пространства лигандов. Предложен фрагментно-ориентированный метод генерации аптамеров, согласованный с бенчмаркинговой схемой оценки.

Еремеева М.А. (науч. рук. Серов Н.С.) Вычислительные подходы к оценке и моделированию взаимодействий аптамеров с малыми молекулами // Сборник тезисов докладов конгресса молодых ученых. Электронное издание. – СПб: Университет ИТМО, [2026]. URL: https://kmu.itmo.ru/digests/article/16258