Статья

Сердюков А.Н. (науч. рук. Замятин А.А.) Разработка инструмента для интерактивной визуализации и скаффолдинга геномных сборок по данным Hi-C
УДК тезиса: 51-76

Целью проекта является разработка программного инструмента, позволяющего в реальном времени визуализировать карты Hi-C контактов и интерактивно выполнять операции скаффолдинга геномных сборок, сопоставимых по размеру с геномом человека. Создание набора программных библиотек и инструментов HiCT было начато в 2022 году. Данная работа посвящена созданию MVP-приложения, реализующего операции скаффолдинга, а также устранению недостатков, выявленных в интерфейсе приложения и в модели данных в процессе апробации HiCT.

Авторы:

Сердюков Александр Николаевич

Руководитель:

Замятин Антон Андреевич

Сердюков А.Н. (науч. рук. Замятин А.А.) Разработка инструмента для интерактивной визуализации и скаффолдинга геномных сборок по данным Hi-C // Сборник тезисов докладов конгресса молодых ученых. Электронное издание. – СПб: Университет ИТМО, [2023]. URL: https://kmu.itmo.ru/digests/article/9827