В данной работе разрабатывается онлайн-инструмент для анализа и визуализации данных секвенирования РНК одиночных клеток. Разрабатываемый инструмент также предоставляет другим исследователям доступ к публичным данных секвенирования РНК одиночных клеток. В рамках данного инструмента был реализован метод поиска: по заданному набору генов (или по одиночным генам) метод находит публичные наборы данных, где экспрессия заданных генов повышена в одной или нескольких популяциях. Мы иллюстрируем применимость данного метода на примере поиска редких популяций в публичных данных секвенирования РНК одиночных клеток.

Зайцев К.В. (науч. рук. Сергушичев А.А.) Поиск генных сигнатур в Single-Cell Navigator позволяет находить редкие клеточные популяции в публичных данных секвенирования РНК одиночных клеток // Сборник тезисов докладов конгресса молодых ученых. Электронное издание. – СПб: Университет ИТМО, [2022]. URL: https://kmu.itmo.ru/digests/article/7806