Работа посвящена созданию программного инструмента, позволяющего в реальном времени визуализировать и интерактивно взаимодействовать с Hi-C данными геномов, сопоставимых по размеру с геномом человека, для решения проблемы скаффолдинга (упорядочивания и ориентации имеющихся последовательностей) и валидации геномных сборок. В рамках данной работы был разработан новый формат хранения данных Hi-C экспериментов, позволяющий эффективно реализовать необходимые запросы, а также утилита, позволяющая преобразовывать существующие данные в этот формат.
Сердюков А.Н. (науч. рук. Замятин А.А.) Разработка программного обеспечения для интерактивного скаффолдинга и валидации геномных сборок на основе данных Hi-C // Сборник тезисов докладов конгресса молодых ученых. Электронное издание. – СПб: Университет ИТМО, [2022]. URL: https://kmu.itmo.ru/digests/article/7627