В данной работе разрабатывается онлайн-инструмент для анализа и визуализации данных секвенирования РНК одиночных клеток. В рамках данного инструмента был реализован метод поиска: по заданному набору генов метод находит публичные наборы данных, где экспрессия заданных генов повышена в одной или нескольких популяциях. Мы иллюстрируем применимость такого метода на примере сопоставления миелоидных клеточных популяций между разными мышиными моделями рака.

Зайцев К.В. (науч. рук. Сергушичев А.А.) Single Cell Navigator позволяет проводить перекрестное сопоставление публичных данных РНК-секвенирования одиночных клеток: пример исследования иммунного микроокружения опухолей // Сборник тезисов докладов конгресса молодых ученых. Электронное издание. – СПб: Университет ИТМО, [2022]. URL: https://kmu.itmo.ru/digests/article/5781