All-atom simulations of Pseudomonas aeruginosa A- and B-form lipopolysaccharides were carried out using GROMACS package. The simulation results visualised in PyMOL showed difference in the conformational mobility of A- and B-forms of LPS.
Волкова Т.Д., Коваленко И.Б. (науч. рук. Рябухина Ю.В.) Molecular dynamics in conformational analysis of Pseudomonas aeruginosa lipopolysaccharides. // Сборник тезисов докладов конгресса молодых ученых. Электронное издание. – СПб: Университет ИТМО, [2019]. URL: https://kmu.itmo.ru/digests/article/2354