Разрабатывается вычислительно-экспериментальный подход к созданию селективных аптамеров к глифосату, сочетающий генерацию последовательностей, их предиктивное ранжирование и структурную приоритизацию. Сравниваются стратегии генерации кандидатов (генетический алгоритм, обучение с подкреплением, дообучение генеративной модели) с унифицированной оценкой на AptaBench; для каждой стратегии формируется набор из 100 последовательностей. Качество контролируется по уникальности и разнообразию, распределениям GC-состава, длины и k-меров, а также по переносимости на новых молекулах. Финальная приоритизация выполняется по метрикам AlphaFold 3. Ожидаемый результат - отбор 10 лучших кандидатов для лабораторной валидации.

Подшибякин А.С. (науч. рук. Серов Н.С.) Разработка вычислительно-экспериментального подхода к созданию селективных аптамеров к глифосату // Сборник тезисов докладов конгресса молодых ученых. Электронное издание. – СПб: Университет ИТМО, [2026]. URL: https://kmu.itmo.ru/digests/article/17201