Аптамеры — одноцепочечные олигонуклеотиды, которые способны связываться с целевыми молекулами и имеют преимущества перед антителами. В исследовании была создана база данных из 1978 пар «аптамер-мишень» и проанализированы более 40 дескрипторов последовательностей. Наилучшие результаты показали дескрипторы ANF и TNC. Разработаны модели классификации и регрессии для фильтрации перспективных аптамеров, достигнув высоких значений точности и детерминации. Также реализован пайплайн для молекулярного докинга, увеличивающий аффинность аптамеров. В дальнейшем планируется экспериментальная валидация аптамера, специфичного к охратоксину А, что важно для пищевой промышленности.

Красовская З.С., Серов Н.С., Еремеева М.А. (науч. рук. Серов Н.С.) Анализ взаимодействия аптамера и малой молекулы с применением машинного обучения и молекулярного моделирования // Сборник тезисов докладов конгресса молодых ученых. Электронное издание. – СПб: Университет ИТМО, [2025]. URL: https://kmu.itmo.ru/digests/article/15341