Разработка алгоритма для поиска мишеней eRNAi направлена на борьбу с патогенами и изучение кросс-царственных взаимодействий между микробиомом и организмом-хозяином. В данном исследовании используются данные метагеномов и транскриптомов. Алгоритм включает сбор данных, аннотацию метагеномов, выделение k-меров и анализ малых РНК. Машинное обучение применяется для классификации мишеней на основе признаков и предсказания активных последовательностей с помощью GAN. В перспективе метод может быть адаптирован для создания РНК-препаратов в сельском хозяйстве.

Кравченко М.А., Адонин Л.С., Иштуганова В.В. (науч. рук. Смутин Д.В., Адонин Л.С.) Рнк-опосредованные взаимодействия: алгоритм поиска мишеней ernai для изучения влияния метагенома // Сборник тезисов докладов конгресса молодых ученых. Электронное издание. – СПб: Университет ИТМО, [2025]. URL: https://kmu.itmo.ru/digests/article/15147