Методы детекции нуклеиновых кислот на основе гибридизации широко используются в диагностике генетических заболеваний, детекции патогенов. Бинарные (разделенные) ДНК-зонды позволяют обнаруживать целевую нуклеиновую кислоту (НК) с высокой чувствительностью и селективностью. Они превосходят ПЦР и ДНК-чипы по простоте анализа и не требуют дорогих реагентов и обученных специалистов. Главный недостаток данного подхода заключается в высокой себестоимости процесса дизайна, требующего нескольких циклов моделирования и тестирования in vitro. В среднем, на один сенсор уходит 4-10 дизайнов, что невыгодно по трудо- и экономическим затратам. Цель данного исследования заключалась в оптимизации дизайна ДНК-зондов при помощи математической модели.

Брюккель А.Г., Горбенко Д.А., Шепелев И.А., Баранникова М.В. (науч. рук. Кошель Е.И.) Оптимизация дизайна ДНК-сенсоров для детекции нуклеиновых кислот при помощи метода аддитивной регрессии // Сборник тезисов докладов конгресса молодых ученых. Электронное издание. – СПб: Университет ИТМО, [2024]. URL: https://kmu.itmo.ru/digests/article/13594