Проводится разработка алгоритмов классификации геномных прочтений бактерий из кишечника пациента после трансплантации микробиоты. В основе реализованных алгоритмов лежит выравнивание прочтений на граф де Брейна. Произведены эксперименты как на синтезированных, так и на реальных метагеномных данных.
Иванов А.Б. (науч. рук. Ульянцев В.И.) Алгоритмы сравнительного анализа серий метагеномных образцов с использованием графов де Брейна для библиотек метагеномных чтений // Сборник тезисов докладов конгресса молодых ученых. Электронное издание. – СПб: Университет ИТМО, [2019]. URL: https://kmu.itmo.ru/digests/article/1298