Такие широко известные и отработанные методы, как ПЦР и LAMP популярны для диагностики различных инфекций. Однако, ПЦР слишком сложна для диагностики в месте оказания первой помощи, а особенности дизайна праймеров для LAMP сильно ограничивают выбор участка ДНК. В данной работе была подготовлена панель для детекции 6 патогенов ЦНС на основе метода изотермической амплификации с праймерами со стволовыми петлями (SPA) с более простым дизайном праймеров и высокой специфичностью и детекция продукта колориметрически с помощью красителя HNB. Было подобрано оптимальное соотношение праймеров, обеспечивающее эффективную амплификацию целевого участка в присутствии матрицы патогена и снижающее неспецифическую амплификацию димеров праймеров, чувствительность для каждого патогена была не ниже 1 мкг ДНК.
Колесникова М.А., Шкоденко Л.А., Бобков Г., Шуб А.С. (науч. рук. Кошель Е.И.) ОПТИМИЗАЦИЯ РЕАКЦИИ ИЗОТЕРМИЧЕСКОЙ АМПЛИФИКАЦИИ С ПРАЙМЕРАМИ СО СТВОЛОВЫМИ ПЕТЛЯМИ (SPA) ДЛЯ КОЛОРИМЕТРИЧЕСКОЙ ДИАГНОСТИКИ ИНФЕКЦИЙ ЦЕНТРАЛЬНОЙ НЕРВНОЙ СИСТЕМЫ В АВТОМАТИЗИРОВАННОМ ДИАГНОСТИЧЕСКОМ УСТРОЙСТВЕ // Сборник тезисов докладов конгресса молодых ученых. Электронное издание. – СПб: Университет ИТМО, [2023]. URL: https://kmu.itmo.ru/digests/article/11717